Елена Герасимова: Я изучаю одноклеточных, обеспечивающих биобезопасность водоемов

- Солнечники — одноклеточные протисты, обитающие в водных и почвенных биотопах, — начинает свой рассказ Елена, показывая сделанное под микроскопом фото радиальных шариков с расходящимися аксоподиями, похожими на лучики солнца. — Клетки солнечников покрыты чешуйками, которые имеют специфичное строение и позволяют различать виды между собой. На сегодняшний день известно около 130 видов солнечников, что по данным секвенирования природных образцов составляет лишь 10% от реально существующего разнообразия данной группы протистов. В экосистемах солнечники выполняют роль пассивных хищников, питаются мелкими жгутиконосцами, водорослями или бактериями. Питаясь бактериями, они выполняют своеобразную роль в очистке водоемов. Зная о солнечниках как о верхнем хищном звене в микробиальных цепях, можно учиться управлять водными экосистемами и их биобезопасностью.

— Откуда Вы приехали в Тюмень? Почему Вы выбрали биологию, протистологию, солнечников…

- В Тюмень я приехала из Оренбурга, работала в Институте клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения РАН. Интерес к биологии появился в школе, заинтересовал предмет и его подача. Изучение биологии продолжила в Оренбургском государственном университете на кафедре микробиологии. С первого курса начала заниматься научной работой — заведующий кафедрой предложил изучать солнечников, и меня затянуло. Изучение этих одноклеточных начинала с точки зрения прикладной математики — создания программы с распознаванием образов и попытки автоматической видовой идентификации представителей группы. Далее продолжила изучение солнечников с применением классических — культуральных, микроскопических и современных методов — ДНК-метабаркодинга. Метабаркодинг позволяет проводить идентификацию живых организмов, изучать таксономический состав сообществ путем амплификации и последующего высокопроизводительного секвенирования маркерных генов, которые выступают в качестве так называемых штрих-кодов для живых организмов. Метабаркодинговые исследования открыли доступ к колоссальному разнообразию ранее неизученных живых организмов и показали, что мы крайне мало знаем о разнообразии протистов.

— Где Вы брали пробы раньше и где собираетесь брать пробы в рамках гранта? Ваши коллеги, открывавшие лабораторию, говорили, что будет большой спектр полевых исследований с выездом на водоемы, исследование Обь-Иртышского бассейна от юга до самого севера — до устья Оби, в месте её впадения в Северный Ледовитый океан. В какие точки области с полевыми исследованиями намерены поехать Вы?

— Область моих интересов — изучение соленых и гиперсоленых водоемов. Ранее мы исследовали солнечников из соленых озер Оренбургской, Челябинской, Курганской областей и Крыма. В рамках гранта планирую продолжить изучение высокоминерализованных биотопов, широко представленных в Западной Сибири. В прошлом году в одной из экспедиций мы отобрали образцы воды на юго-востоке Тюменской и востоке Курганской областей для микроскопических и метобаркодинговых исследований. Сейчас занимаемся обработкой полученных данных. В предстоящих экспедициях по Западной Сибири планируем расширение географии исследований — выезд на реки, озера, болота Обь-Иртышского бассейна. В экспедициях будем изучать состояния водных экосистем и сообществ гидробионтов в условиях антропогенного воздействия и глобального изменения климата. Важность изучения гидробиоценозов обусловлена их индикаторной функцией и способностью реагировать изменением видового богатства и численности в ответ на изменения гидрохимических показателей водной среды и климата.

— Оснащение тюменской лаборатории достаточно ли для Вашего исследования, или она ещё в процессе комплектации, и будет докуплено оборудование?

— На сегодняшний день в лаборатории имеется оборудование, необходимое для выполнения исследований на мировом уровне, закуплены высококлассные микроскопы с рельефным контрастированием объектов, оборудование для молекулярно-генетических исследований. Также есть доступ к уникальному оборудованию — генетическому секвенатору, ультрамикротому, электронному микроскопу. Стоит отметить, что лаборатория находится на стадии комплектации и закупки оборудования будут продолжаться в соответствии с планом и поставленными задачами.

— Как Вам взаимодействие с тюменскими учеными, с руководителем гранта — Денисом Тихоненковым?

— Я в Тюмени относительно недавно, но была знакома с учеными из лаборатории антимикробной резистентности Института X-BIO, во время летней экспедиции познакомились с коллегами из Института биологии и Института биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН. Коллеги помогают мне освоиться и завести новые знакомства. С Денисом Тихоненковым активно взаимодействуем по вопросам функционирования лаборатории.

— Как Вам наш город? По Тюмени за неделю прошлись?

Источник: