Палеонтологическая коллекция В фондах музея представлены ископаемые фораминиферы, кораллы, трилобиты, моллюски (пелециподы, аммониты, белемниты), брахиоподы, мшанки, морские лилии. Ряд коллекционных материалов был привезен доцентом кафедры А.В.Толстиковым из поездки по изучению выходов пород каменноугольного периода в штате Канзас, США. К наиболее интересным экспонатам можно отнести подборку трилобитов, белемнитов («чертовых пальцев»), крупного аммонита (около 1 м в диаметре). Коллекции активно используются в учебном процессе по курсам «Общая палеонтология» и «Палеозоология беспозвоночных» (читают доценты Н.Я.Попов, А.В.Толстиков).