История Зоологического музея восходит к первой половине XX  века. Началом основания его можно считать 1935 год и связана эта дата с приездом в Тюмень для работы в Тюменском пединституте преподавателя Анатолия Дмитриевича Шаронова. Зоологический кабинет в это время насчитывал чуть более пяти экспонатов, собранных преподавателем Ф.Ф.Ларионовым, это чучела серой куропатки, беркута, вальдшнепа, зайца – беляка (меланиста) и некоторых других.
 Образовав небольшую группу из студентов, основатель музея А.Д.Шаронов приступил к сбору материалов. Стали появляться, в первую очередь, тушки птиц, обитающих в наших лесах. Богатый материал был собран А.Д.Шароновым в 1936 году во время его экспедиции по северу Тюменской области. Коллекцией сибирской фауны заинтересовался Ленинградский зоологический институт. Начался обмен тушками и чучелами. Так в нашем музее стали появляться чучела птиц, обитающих в различных уголках Земного шара: колибри, зимородки, нектарницы и другие – всего около 10 видов. Самые старые экспонаты относятся к 1829 году. Также появился в музее стервятник из коллекции академика Н.А.Северцова (1827 - 1885). В этом же 1936 году музей пополнился и чучелами копытных животных из коллекции известного путешественника Н.М.Пржевальского (1839 - 1888) – в определенном смысле кумира А.Д.Шаронова, которые также были куплены в Ленинградском зоологическом музее: марал, сибирский козерог, архар и среднеазиатский тур. Значительным для музея был 1937 год. В этом году начали оформлять биологические группы, продолжаются интенсивные сборы материала в междуречье Надыма и Тромъегана. Немалую роль для пополнения и оформления музея сыграл лаборант Я.Д.Кобяков, который хорошо препарировал, рисовал и был удачливым охотником.

Ф. Ф. Ларионов 1936 г.jpg Шаронов А.Д..jpg Шапошников Ф. Д..jpg Н.Ягодников.jpg

Во время Великой Отечественной войны в связи с передачей помещений под эвакогоспитали Зоомузей был практически расформирован. В послевоенные годы много сил и времени было потрачено на поиски экспонатов и еще больше на их восстановление. И опять многое было сделано вернувшимся в 1945 году с фронта А.Д.Шароновым, который стал заведовать кафедрой зоологии. Постепенно коллекция снова начала пополняться чучелами, а еще больше тушками животных, в первую очередь птиц. Вместе с А.Д.Шароновым в работе участвовали преподаватели (например, декан Н.А.Ягодников), студенты и даже школьники, посещавшие организованный им кружок. Среди последних был и М.П.Рощевский – ныне академик РАН, д.б.н., председатель Президиума Коми научного центра Ур. ОРАН.
     С 1955 года в комплектовании коллекции Зоомузея активное участие принимал и Федор Дмитриевич Шапошников, заведующий кафедрой зоологии. Активно и в новом направлении развернулась работа по развитию музея с переходом на работу из Тюменского областного краеведческого музея в педагогический институт в 1960 году Василия Евгеньевича Кюкена, хорошего таксидермиста, с любовью выполняющим свое дело, проработавшего здесь учебным мастером до 1992 года. Вместе с Ф.Д. Шапошниковым он постоянно выезжал за новым материалом для коллекций, перенимая от Федора Дмитриевича богатый опыт. В это время Василием Евгеньевичем было сделано тогда еще одно из немногих его крупных чучел – рысь. Только в 1964 году, благодаря настойчивости В.Е.Кюкена, под музей была выделена отдельная комната площадью чуть более 40 кв. м. Им же была составлена и первая экспозиция музея (он руководил работой, готовил эскизы шкафов, размещал чучела и т.д.). С этого времени Зоомузей стал широко использоваться в учебном процессе, в нем проводились экскурсии школьников городских и сельских учебных заведений. К работе шире стали привлекаться студенты. Они не только принимали участие в сборе материала, но и сами препарировали животных. Под руководством В.Е. Кюкена стал работать кружок по таксидермии. Все чучела стали принимать характерные позы, для живых птиц и зверей.

                      Кюкен В.Е..jpg  Т.И. Рыбакова и А.Д. Парфёнов с новыми экспонатами музея.jpg

Начиная с 1971 года активное участие в работе зоологического музея принимала к.б.н., доцент Тамара Ивановна Рыбакова. С 2000 по 2015 гг. она официально являлась заведующей зоологическим музеем Тюменского госуниверситета и в этой должности активно пропагандировала идеи охраны природы среди студентов и школьников города и области.
     
В 1981 году биологический факультет расположился в отдельном корпусе (в пос. Нефтяников). Под музей выделена площадь в 126 кв.м. И снова основная работа по размещению музея проводится В.Е.Кюкеном.  Много и с большим интересом ему помогают выпускники биофака, приемники и последователи В.Е. Кюкена – А. Парфенов, С. Баянов, И. Халитов, И. Шарафутдинов и др. Они провели большие реставрационные работы, создали новые экспозиции. Так были сооружены подставки для копытных животных и ластоногих, сделана диорама "Медведь на муравейнике", для мелких воробьиных птиц изготовлены изящные витрины. В эти годы попали немногочисленные палеонтологические экспонаты из коллекции И.Н.Семенова. С 1982 г.  и по сегодняшний день ведущим мастером-таксидермистом зоологического музея является ученик В.Е.Кюкена - А.Д. Парфенов.
 В 2000 году на базе зоологического музея создан Научно – исследовательский центр по изучению биологического разнообразия Тюменской области "Зоомузей ТюмГУ".  
 В 2008 году Зоологическому музею было присвоено имя В.Е. Кюкена.