Научно-исследовательская лаборатория антимикробной резистентности


Васильченко.png
       Руководитель
Васильченко Алексей Сергеевич
к.б.н., н.с.
Scopus ID 36967720800
   

Контактная информация
Тел.: (3452) 45-51-07 
E-mail: a.s.vasilchenko@utmn.ru
Адрес:  г. Тюмень, ул. Ленина, 23, лаб. 14
Почтовый адрес: 625003, г. Тюмень, ул. Володарского, 6 



Направления исследований

1. Биологические средства защиты растений на основе антимикробных веществ растительного и микробного происхождения.

Результатом будет являться получение обширных данных о разнообразии антимикробных соединений полипептидной природы, продуцируемых бактериями, экстремофильными грибами и дикорастущими растениями; их структурно-функциональном анализе и фундаментально-ориентированных основах для их применения в качестве потенциальных действующих веществ биопестицидов и антибиотиков нового поколения, рекомендуемых для применения в интегрированной системе защиты растения. 

В ходе работы будут решены следующие задачи:
  • Расширение коллекции штаммов-антагонистов и оценка спектра их активности. Оптимизация продукции антимикробных веществ штаммами-продуцентами. Разработка алгоритма очистки целевых веществ. Получение препаративных количеств АМП. 
  • Структурно-функциональная характеристика антимикробных пептидов и белков: устойчивость в окружающей среде, фито- и цитотоксичность и особенности летального и сублетального воздействия на фитопатогены. 
  • Разработка прототипа биопестицида/ов на основе одного или группы АМП с целью проведения лабораторных экспериментов формата «green-house» по ультрамалообъемному опрыскиванию культурных растений в период вегетации. Анализ воздействия пептидных биофунгицидов на почвенный микробиом в сравнительном эксперименте с существующими в защите растений биологическими средствами и химическими пестицидами. 


2. Субингибиторные эффекты антимикробных пептидов в аспекте структурно-функциональной связи

В субингибиторных концентрациях действие антимикробных веществ на бактерии может иметь разноплановые эффекты, которые зачастую невозможно спрогнозировать. В данном проекте предлагается проведение комплексного исследования субингибиторных эффектов серии модельных антимикробных пептидов в отношении различных популяций микроорганизмов и определение ключевых структурно-функциональных свойств подобных молекул, запускающих развитие той или иной стресс-реакции. 

Новизна проекта определяется смещением фокуса в исследовании антимикробных пептидов с их летального действия на не летальные эффекты. При этом будут проанализированы взаимосвязи между физико-химическими свойствами пептидов и спектром индуцируемых субингибиторных эффектов. Полученные результаты после математической обработки могут быть положены в основу создания математической модели прогнозирования тех или иных субингибиторных эффектов в зависимости от структуры конкретного антимикробного пептида.


3. Изучение молекулярных механизмов резистентности бактерий к антимикробным веществам

В данном проекте будут получены новые данные об особенностях и механизмах формирования резистентности модельных бактериальных штаммов к антимикробным веществам, в том числе пептидной природы.
  • Будет проведен анализ генома и транскриптома микроорганизмов, который позволит определить отдельные гены или группы генов, участвующие в развитии резистентности к антимикробным веществам различной природы.
  • Будет исследован фенотипическая реализация устойчивости микроорганизмов к антимикробным соединениям и определена взаимосвязь с генетическими изменениями 



Текущие проекты
  1. 2020-2023 гг. «Биологические средства защиты растений на основе антимикробных веществ растительного и микробного происхождения». Госзадание на НИР Министерства науки и высшего образования РФ.
  2. 2019-2021 гг «Модернизация методов мониторинга и контроля болезней полевых культур в России». РНФ 19-76- 30005.
  3. 2018-2020 гг «Изучение антимикробных пептидов растений и грибов - биофунгицидов нового поколения». РНФ 18-74-10073.
  4. 2018-2020 гг «Сравнительный анализ антимикробных пептидов дикорастущих и культурных растений в аспекте исследования молекулярных механизмов врожденного иммунитета к биотическим стрессовым факторам». РФФИ 18-34-20058 мол_а_вед.


СМИ о деятельности лаборатории



Фотогалерея


-BIO
Институт экологической
и сельскохозяйственной
биологии
ТюмГУ

625003, Тюменская область,
г. Тюмень, ул. Ленина, 25

Михаил Жак
Заместитель директора
(3452) 59-74-00
Марат Шамсимухаметов
Руководитель учебного офиса
(3452) 59-74-00