Исследовательская группа интегральных биоаналитических систем


Andreev.png
        Научный руководитель группы
Андреев Дмитрий Станиславович 

E-mail: d.s.andreev@utmn.rudan14444@yahoo.com

Подробнее Научные интересы
  • Анализ гетерогенности клеток и митохондрий для терапии инфекций, канцерогенеза и старения. В первую очередь - мультиплексный анализ: проточный анализ частиц, оптический анализ аналитических матриц, микроспектроскопия. Методы: микрофлюидика капиллярная и в «лабораториях-на-чипе», 3D-печать, литография, электроосмотика, магнитофорез.
  • Разработка аналитического и терапевтического оборудования: железо, софт, методики.
  • Инженерия микро- и наноразмерных диагностических, терапевтических и тераностических частиц и структур; методы управления такими частицами.
Образование
  • Ноябрь 2007 – Ph.D. в биоаналитической химии и материаловедении. Химический факультет Университета Миннесоты, Миннеаполис, США. Диссертация: Разработка моделей и аналитических подходов для индивидуальных митохондрий
  • Июнь 1996 – М.S./специалист в химии.Государственный Университет Айовы, Эймс, США/ Высший Химический Колледж Российской Академии Наук, Москва, РФ. Дипломная работа: Новые биоаналитические приложения поверхностно-усиленной флуоресценции.


Об исследовательской группе

Междисциплинарная группа, специализирующаяся на разработке биоаналитических инструментов и методов высокой мультиплексности, в первую очередь в парадигмах «лаборатории в чипе» и микрофлюидики.

Основная задача: обеспечение клинической медицины инструментами для диагностики и тераностики, а биомедицинских исследований – аналитическими инструментами.



Основные направления работ

Диагностические системы: разработка диагностических чип-ориентированных инструментов высокой мультиплексности, т.е. одновременно определяющих множество параметров. Методологически приоритетны проточные методы и имидж-анализ аналитических матриц. Инженерия чипов базируется на литографии и 3D-печати. В анализе данных используются алгоритмы и программное обеспечение собственной разработки. Приоритетной клинической целью является диагностика переносимых клещами заболеваний и COVID – подобных инфекций.



ГТФФ-анализ: разработка инструментов, анализирующих одновременно генотип, транскриптом, фенотип и функциональные свойства клеток, митохондрий, экзосом и иных содержащих полинуклеотиды частиц в большой популяции. Приоритетна интеграция цитометрии с методами микрокапельного кодирования полиноклеотидов индивидуальной частицы , такими как DropSeq.

БиоФабЛаб: создание образовательно-производственной структуры для подготовки приборостроительных кадров, коммерциализации попутных разработок и выращивания приборостроительных импортозамещающих стартапов. В частности, для ГТФФ-анализа планируемыми «попутными разработками» являются создание отечественного производства цитометров и FACS-ов, а также мультиплексных частиц для микрокапельного кодирования и аналитических матриц.


Также, в области интересов группы находятся:

Дизайн пустотелых, магнитных , плазмонных и флуоресцентных наночастиц и их ансамблей – для доставки лекарств и тераностики;
Электромагнитная манипуляция частицами в жидкости и газе: электростатические фильтры и сортировщики; диэлектрофорез , магнетофорез, электрофорез капиллярный и свободного потока; оптические манипуляции; электроосмотика;
Терапевтические микрофлюидные чипы для использования CAR-T и химерных адаптеров иммуноглобулиновых рецепторов.


Вакансии

Посмотреть полный список вакансий можно здесь




Состав исследовательской группы


1 Андрей Л.jpg
       Лисица Андрей Валерьевич
Главный научный сотрудник
E-mail: a.v.lisica@utmn.ru
Подробнее Научные интересы
  • Биоинформатика, 2016 академик РАН (Отделение медицинских наук РАН)
2016 – академик РАН (Отделение медицинских наук РАН)
Образование
  • 2007 – д.б.н, тема диссертации: «База знаний по цитохромам Р450: разработка и применение»
  • 2002 – к.б.н, тема диссертации: «Протеомный индекс надсемейства цитохромов Р450»
   
       
2 Леонид А.jpg   Адонин Леонид
Старший научный сотрудник
E-mail: leo.adonin@gmail.com   
Подробнее Научные интересы
  • Регуляция механизмов эмбриогенеза
  • Некодирующая РНК
  • Транспозоны как основной источник функциональной некодирующей РНК
Образование
  • 2013 – кандидатская диссертация в диссертационном совете при Институте Цитологии РАН
  • 2009 – кафедра Цитологии и гистологии СПбГУ (г. Санкт-Петербург, Россия)

   
       
1 Данила З.jpg
  Зименков Данила Вадимович
Старший научный сотрудник
E-mail: z@biochip.ru
Подробнее Научные интересы
  • Генетика патогенеза и лекарственной устойчивости микроорганизмов
  • Молекулярные механизмы патогенеза возбудителя туберкулеза
  • Молекулярная диагностика
Образование
  • 2003 инженер-физик по специальности «Радиационная безопасность человека и окружающей среды», факультет теоретической и экспериментальной физики Московского ордена Трудового Красного Знамени Инженерно-Физического Института (технического университета), г. Москва
  • 2005 кандидат биологических наук по специальности 03.00.03 – «молекулярная биология». Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов, г. Москва. Тема диссертационной работы – «Открытая рамка считывания ybhE Escherichia coli кодирует ранее неизвестную 6-фосфоглюконолактоназу (Pgl)»

 

   
Bakanov.jpg   Баканов Алексей Георгиевич
Научный сотрудник
E-mail: a.g.bakanov@utmn.rualeksei.bakanov@gmail.com
Подробнее Научные интересы
  • Плазмоника и плазмонныенаноструктуры, SPASERs
  • Квантовые точки, металлические наночастицы
  • Оптическая спекторскопия, SERS, FRET, эффект Парселла, стимулированная эмиссия
Образование
  • Июнь 2011 – Специалист (Физик. Инженер). Физико-технический факультет Гродненского государственного университета имени Янки Купалы (г. Гродно, Республика Беларусь). Дипломная работа: Влияние солюбилизации наночастиц CdSe/ZnS на их оптические свойства
  • Июнь 2013 – Магистр (Оптика наноструктур). Факультет фотоники и оптоинформатики Университета ИТМО (г. Санкт-Петербург, Россия). Дипломная работа: Фотофизические свойства комплексов CdSe/ZnS квантовых точек с сульфофталоцинином, входящим в состав препарата «Фотосенс».
  • Декабрь 2016 – Кандидат физ.-мат.наук (специальность 01.04.05 - «Оптика»). Факультет фотоники и оптоинформатики Университета ИТМО (г. Санкт-Петербург, Россия). Тема кандидатской диссертации: Исследование оптических свойств полупроводниковых квантовых точек в ближнем поле плазмонных наночастиц.
 

   
2 Елена Л.jpg
  Савватеева Елена Николаевна
Научный сотрудник
E-mail: len.savv@gmail.com
Подробнее Научные интересы
  • Мультиплексный иммуноанализ белков
  • Гуморальный иммунный ответ
  • Ранняя диагностика аутоиммунных, онкологических и вирусных заболеваний
Образование
  • 2003 магистр по направлению «Химическая технология и биотехнология». Факультет биотехнологии и органического синтеза, кафедра биотехнологии Московской государственной академии тонких химических технологий им. М.В. Ломоносова, г. Москва
  • 2009 кандидат химических наук по специальности 03.01.03 – «молекулярная биология». Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта Российской академии наук, г. Москва. Тема диссертационной работы – «Одновременный количественный иммуноанализ маркеров онкологических заболеваний в сыворотке крови на биологическом микрочипе»
 

   
3 Марина Ф.jpg
  Филиппова Марина Александровна
Научный сотрудник
E-mail: mafilippova@mail.ru
Подробнее Научные интересы
  • Химия поверхностей и гидрогелей
  • Биологические микрочипы
  • Мультиплексный иммуноанализ
Образование
  • 2003 г – магистр техники и технологии по направлению «Химическая технология и биотехнология». Факультет биотехнологии и органического синтеза, кафедра биотехнологии Московской государственной академии тонких химических технологий им. М.В. Ломоносова, г. Москва
  • 2011 г - кандидат химических наук по специальности 03.01.03 – «молекулярная биология». Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта Российской академии наук, г. Москва. Тема диссертации – «Одновременный количественный анализ бактериальных и растительных биотоксинов на гидрогелевых микрочипах».

 
   
4 Сергей П.jpg    Поляков Сергей Александрович
Ведущий инженер
E-mail: polyakov.sergey@bk.ru
Подробнее Научные интересы
  • Молекулярная биология, молекулярная генетика, медицинская диагностика
  • Флуоресцентные красители, флуоресцентное маркирование биомолекул
Образование
  • 2012 – Московский государственный университет тонких химических технологий имени М. В. Ломоносова (г. Москва, Россия) Магистр техники и технологии по направлению «Химическая технология и биотехнология»

 
   
Анна.jpeg   Насырова Анна Владимировна
Инженер
E-mail: nasyrovaanna51@gmail.com
ПодробнееНаучные интересы
  • Биоаналитическое приборостроение
  • Оптика
Образование
  • 2020 – Магистр (Техническая физика). Физико-технический институт  ТюмГУ, (г. Тюмень, Россия). Дипломная работа: Классификация низкопроницаемых коллекторов по степени влияния нелинейных эффектов на фильтрацию
  • 2018 – Бакалавр (Физика). Физико-технический институт ТюмГУ (г. Тюмень, Россия). Дипломная работа: Методы определения селективной проводимости полупроницаемых мембран 

 
   
5 Олег Х..jpg    Харченко Олег Борисович
Инженер-исследователь
E-mail: obkharchenko@mail.ru
Подробнее Научные интересы
  • Электронная аппаратура
  • Электронно-вычислительная аппаратура
  • Экономические основы управления снабжения запасами предприятия
  • Менеджмент (основы)
Образование
  • 1986 – инженер-конструктор-технолог, Харьковский институт радиоэлектроники (г. Харьков, Украина)    

 
   
11.jpg    Худышкин Вячеслав
Инженер-исследователь
E-mail: khudyshkin@yandex.ru
Подробнее Научные интересы
  • CAD, G-code, 3D-печать оптическая и экструзионная, микрофрезеровка, литография, литьё и т.д.
  • Разработка, сборка, настройка и адаптация лабораторных приборов и оборудования.
  • Химия микро и наночастиц, поверхностная химия. Капельная микрофлюидика, синтез частиц. Привязка биомолекул и красок.
  • Сборка, отладка электронных схем, в том числе использующих микроконтроллеры.
Образование 
  • Июнь 2020 – Магистр, специальность «Химия нефти и экологическая безопасность». Институт химии ТюмГУ (г. Тюмень, Россия)
  • Июнь 2018 – Бакалавр, специальность «Академическая химия». Институт химии ТюмГУ (г. Тюмень, Россия)

 
   
4 Егор Л.jpeg
  Лебедев Егор Евгеньевич
Лаборант-исследователь
E-mail: mainsalta@gmail.com
Подробнее Научные интересы
  • Некодирующие РНК (miRNAs, lncRNAs)
  • Эмбриология
  • Биоинформатика
Образование
  • Ноябрь, 2020 – по настоящее время – Аспирантура (Энтомология) института экологической и сельскохозяйственной биологии (X-BIO) Тюменского государственного университета (г. Тюмень, Россия) 
  • Июль, 2020 – Магистр (Биологические системы: структура, функции, технологии). Дальневосточный федеральный университет (г. Владивосток, Россия) 
  • Дипломная работа: Анализ экспрессии миРНК в раннем эмбриональном развитии пурпурного морского ежа. 
  • Июль 2018 – Бакалавр (Молекулярно-клеточные системы и биотехнологии). Дальневосточный федеральный университет, г. Владивосток, Россия. 
  • Дипломная работа: Транспозоны морского ежа Strongylocentrotus intermedius: in silico versus in vitro

 
   
8 Марат Ш.jpg   Шамсимухаметов Марат
Менеджер образовательных проектов
E-mail: m.shems@utmn.ru
Подробнее Научные интересы
  • Международное и естественно-научное образование
Образование
  • 2017 – MA Science education, UCL Institute of Education (г. Лондон, Великобритания)
  • 2010 – Бакалавр, Биолого-Почвенный факультет СПбГУ (г. Санкт-Петербург, Россия)

 
   
Флягина.jpg
  Флягина Дарья Юрьевна
Менеджер по закупкам
E-mail: popova.d.y@gmail.com
Подробнее Образование 
  • 2014 – Экономика и управление на предприятии. Байкальский государственный университет экономики и права (г. Иркутск, Россия)
   
       
Алиса М 10.jpeg    Менщикова Алиса Константиновна
Студентка
E-mail: menalisik@yandex.ru
Подробнее Научные интересы
  • Разработка инструментов и методов анализа индивидуальных клеток в популяции
Образование
  • Сентябрь 2018 – по настоящее время – Бакалавриат (Биохимия), Институт биологии ТюмГУ (г. Тюмень, Россия)
     

Анастасия 11.jpeg    Шальнева Анастасия Сергеевна
Студентка
E-mail: ndrew2093@gmail.com
Подробнее Научные интересы
  • Генетическая вакцинация, drop out
Образование
  • Июль 2020 – бакалавр (институт биологии Тюменского государственного университета), дипломная работа: Выделение и очистка плазмидной ДНК для последующего секвенирования
  • Сентябрь 2020 – настоящее время – магистратура (биотехнологии), Институт биологии ТюмГУ (г. Тюмень, Россия)
   
 
Дмитрий С.jpeg   Савченко Дмитрий Васильевич
Студент
E-mail: d.savchenko.sas@gmail.com 
Подробнее Научные интересы
  • Эпигенетика, Научная коммуникация
Образование
  • Август 2018 – по настоящее время – Бакалавр, направление «Науки о Жизни», School of Advanced Studies, ТюмГУ (г. Тюмень, Россия)
     




Научные публикации группы
  1. L. K. Kurbatov, S. P. Radko, S. V. Kravchenko, O. I. Kiseleva, N. D. Durmanov, and A. V. Lisitsa. Single Stage Purification of CRISPR/Cas13a Nuclease via Metal-Chelating Chromatography Following Heterologous Expression with the Preservation of Collateral Ribonuclease Activity. Applied Biochemistry and Microbiology, 2020, Vol. 56, No. 6, pp. 671–677
  2. Andreyev, D.; Zybailov, B. Integration of flow cytometry and single cell sequencing. Trends Biotechnol., 2020. 38(2), p. 133-136




-BIO
Институт экологической
и сельскохозяйственной
биологии
ТюмГУ

625003, Тюменская область,
г. Тюмень, ул. Ленина, 25

Михаил Жак
Заместитель директора
(3452) 59-74-00
Джамиля Укарханова
Руководитель учебного офиса
(3452) 59-74-00